尿常规检查见白细胞计数增多或呈脓尿，伴有红细胞增多，少数呈肉眼血尿，尿三杯试验检查，可以发现第1杯内有大量脓细胞，红细胞存在，而第2杯，第3杯基本正常，初段尿细胞培养菌数明显多于中段尿，尿道或阴道分泌物涂片检查，淋菌性尿道炎可见细胞内或细胞外淋病双球菌，非特异性尿道炎可用分泌物或前尿道拭子培养，见大量细菌生长，分泌物涂片及培养均未发现细菌者，即有支原体，衣原体感染的可能，可行特殊方法培养或做PCR检查。
慢性尿道炎需行尿道膀胱镜检查，以明确发病的原因，有时可用金属尿道探子试探尿道内有无狭窄，必要时行尿道造影，急性期尿道内忌用器械检查。
根据病因、临床表现和实验室检查明确诊断。
男性患者的并发症有附睾炎、前列腺炎、精囊炎等；妇性患者的并发证有子宫内膜炎、输卵管炎、盆腔炎、腹膜炎等。
尿道内感染可直接蔓延到膀胱或前列腺而引起膀胱炎或前列腺炎。急性尿道炎若处理不当可并发尿道旁脓肿，脓肿可穿破阴茎皮肤成为尿道瘘。在尿道炎症愈合过程中纤维化则可引起尿道狭窄。
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